El nombre de Orden de San Juan puede aludir a alguna de las siguientes corporaciones religiosas o nobiliarias:
- Orden de San Juan de Jerusalén, antiguos caballeros hospitalarios.
- Orden de San Juan de Dios, más conocida como Orden Hospitalaria de San Juan de Dios, una orden mendicante católica fundada en 1572 por discípulos de San Juan de Dios.
- Orden de San Juan de Jerusalén u Orden de Malta, orden religiosa y militar de origen medieval que sobrevive hasta la actualidad.
- Orden de San Juan (Bailiazgo de Brandeburgo), rama protestante en Alemania.
- Venerable Orden de San Juan, rama protestante en el Reino Unido.
